Этот значок щита существует из-за внесенных вами изменений манифеста. Способ предотвратить это - удалить эти изменения.
Я не уверен, что вам нужно установить этот манифест для запуска MSI; Я считаю, что запуск MSI сам по себе запросит повышенные привилегии, поэтому вашему приложению не нужны сами повышенные привилегии.
В качестве альтернативы, вы могли бы иметь код, который запускает MSI, сам требующий прав администратора, вместо того, чтобы это требовалось для всего приложения, что и делает информация манифеста.