Вы не можете.Вы должны вручную добавить новую диаграмму классов и поместить все классы сущностей, сгенерированные EF, в эту новую диаграмму.В качестве альтернативы, если вы понимаете содержание EDMX, вы можете написать собственный шаблон T4 или XSLT, чтобы преобразовать его в другой формат, представляющий, например, диаграмму классов UML.