Если вас интересует конкретный выбор, вы должны сделать следующие вещи для каждого QModelIndex в списке:
QFileSystemModel* p_fs_model;
...
foreach(QModelIndex index, whole_selection)
{
QModelIndex first_column_index = p_fs_model->index(
index->row(),
0, /* first column index */
index->parent()
);
...
}