Просто добавьте их во второй ряд так:
INSERT INTO table (a,b,c) VALUES (1,2,3)
ON DUPLICATE KEY UPDATE c=c+1, b=b+3, ...
На нескольких вставках одновременно вы можете ссылаться на значения, подобные этим:
INSERT INTO table (a,b,c) VALUES (1,2,3),(4,5,6)
ON DUPLICATE KEY UPDATE c=VALUES(a)+VALUES(b);
Посмотрите на Документы для получения дополнительной информации о синтаксисе.