Ничего не автоматизировано - в обозревателе решений вы можете выбрать узел проекта и нажать кнопку Show All Files.
Затем вы увидите, что файлы и папки, на которые проект не ссылается, выделены серым цветом.
Если вы хотите автоматизировать это, вы можете создать список всех файлов в каталоге проекта и подкаталогах изОС (например, используя dir и перенаправляя вывод в файл) и анализирует файл проекта, чтобы получить список всех файлов, на которые он ссылается.На этом этапе следует сравнить оба списка.