Мне интересно, если JQuery-версия TinyMCE имеет меньше проблем с совместимостью браузеров, благодаря JQuery.
Нет, совместимость такая же.Но я настоятельно советую вам не использовать сборку jQuery tinymce.Это медленнее, чем обычная сборка tinymce, вероятно из-за накладных расходов на создание объекта jquery.