Если вы запустите
./configure --help
, вы увидите, что действительно нет опции 'with-libyaml-dir', он не поддерживается основным скриптом настройки Ruby.
Эти параметры "with-xxx-dir" часто используются во время компиляции расширений, когда вы создаете Makefile, запуская
ruby extconf.rb --with-libimportantforextension-dir=...
В вашем случае обходным решением будет установкаlibyaml с использованием apt-get:
sudo apt-get install libyaml
Таким образом, RVM, вероятно, распознает, что оно уже установлено, и не будет пытаться загрузить и установить его в другое место, поэтому вы не должны получать ошибку, которую вы в данный момент видитеполучить больше.