Не помещайте local.properties в VCS: генерируйте его, когда он еще не существует (например, после чистой проверки), запустив
android update project -p .
, чтобы android мог сгенерировать его с нужнымпуть к SDK.ant.properties или project.properties предназначены для помещения в VCS с любыми необходимыми исправлениями во всех возможных средах сборки.
Если вы не хотите, чтобы build.xml был изменен, измените запись тега версиив значение, отличное от значения по умолчанию, которое равно 1. Например:
<!-- version-tag: custom -->
Если вы посмотрите на комментарии build.xml, это говорит о том, что:
***********************
****** IMPORTANT ******
***********************
In all cases you must update the value of version-tag below to read 'custom' instead of an integer,
in order to avoid having your file be overridden by tools such as "android update project"