Во-первых, вам нужно создать ключ из вашего идентификатора.Вы можете сделать это следующим образом (при условии, что ваша сущность User не имеет родителя):
user_key = db.Key.from_path('UserInfo', user_id)
Теперь вы можете использовать его в запросе так же, как и в любом другом случае:
db.GqlQuery("SELECT * FROM List WHERE user_key = :1", user_key)
Илиэквивалентно запросу вместо GQL:
List.all().filter("user_key =", user_key)