SSIS, как следует из названия, полезен для интеграции / преобразования данных из разных источников. Если вы все делаете на SQL Server - используйте хранимые процедуры. И этого должно быть достаточно для ваших нужд. Временные таблицы будут очень полезны здесь.
С другой стороны ...
SSIS - очень мощный инструмент, потому что вся работа с потоками данных выполняется в оперативной памяти, поэтому это быстро, но вам нужно беспокоиться о потреблении памяти. Это зависит от объема данных, но вам также следует избегать любых асинхронных операций (группировка, сортировка), потому что они могут легко заполнить вашу память. Если в потоке данных будет много трансформаций, обновлений, расчетов и т. Д., SSIS может быть еще быстрее.
Но ...
У вас есть третий вариант здесь. Объедините их, используя компоненты «Поток данных» и «Выполнить задачу SQL».