Это обычно происходит, когда вы находитесь в неправильном каталоге и запускаете ndk-build.Убедитесь, что в вашем текущем каталоге есть папка «jni» (в вашем примере папка ndkpath)
Посмотрите, как структурированы сэмплы из NDK.Например, hello-jni:
hello-jni
|
+--- jni
| |
| +--- Android.mk
| |
| +--- hello-jni.c
|
+--- res
| |
| ...
|
+--- src
| |
| ...
|
+--- AndroidManifest.xml
Если вы используете ту же структуру, вы должны вызвать ndk-build из верхнего каталога - каталога hello-jni.