Как сказал пользователь 65Fbef05, оба видео должны иметь одинаковую частоту кадров
использовать -f частоту кадров и частоту кадров должны быть одинаковыми в обоих видео.
Чтобы найти частоту кадров, используйте:
ffmpeg -i video1
ffmpeg -i video2
и найдите строку, содержащую «Stream # 0.0: Video:»
, в этой строке вы найдете fps в фильме.
Также я не знаю, с какими проблемами вы столкнетесь, микшируя 2 звуковых дорожки.
Со своей стороны я постараюсь использовать звук из фильма, который будет наложен
, и отброситьотдых.