Nib-файлы хранятся в формате XML, который обычно может обрабатываться git.Я бы не стал выполнять автоматическое слияние файлов XML, поскольку структура может быть повреждена, что, вероятно, произошло в вашем случае.Если вы откроете файл пера в текстовом редакторе, вы сможете угадать, как создается файл пера.Затем я попытался бы выполнить слияние вручную, сохранив структуру объекта в nib-файле без изменений.