Это на самом деле стандартная проблема с .NET. В общем, когда вы создаете отдельный проект, который будет встроен в dll, вы можете создать настройки в файле app.config. Эти настройки не становятся автоматически частью web.config приложения, использующего DLL.
«Решением» всегда было: скопируйте и вставьте из app.config вашей библиотеки и вставьте в app.config или web.config приложения-потребителя.
Это на самом деле имеет определенный смысл: эти параметры конфигурации должны изменяться в зависимости от среды, в которой выполняется код. Один набор конфигурации для вашего клиента WCF, хранящийся в одном месте, возвращает нас к дням регистрации.