Конечно, нет причин, по которым ты не мог. Технология на стороне сервера не имеет значения (ну, не должно иметь значения ... Я думаю, плохой дизайн веб-приложения может иметь значение). Если вы можете подключиться к веб-серверу, вы можете подключиться к веб-серверу.
Между прочим, ".NET веб-сервер" не совсем точен. IIS? Apache с mod_mono? Опять же, с точки зрения клиента это не должно иметь значения.