Рядом с проверкой:
Edit Category -> Display Settings -> Is Anchor
Также проверьте:
Edit Category -> Design -> Layout Update XML
Если поле Layout Update XML
имеет следующий код, то layered navigation
не будет отображаться в конкретной категории, которую вы редактируете:
<referenceContainer name="catalog.leftnav" remove="true"/>