Обновление:
NetBeans 7.4 Выпущено в октябре 2013 года и базируется на перечисленных ниже функциях.А также прямая загрузка большинства основных исходных файлов JS с CDNJS.Версия 7.4 включает «Поддержка редактирования для платформ AngularJS, Knockout и ExtJS, Навигатор и свертывание кода в файлах JSON, Расширенное завершение кода с повышенной точностью», подробнее см. Здесь: https://netbeans.org/community/releases/74/
Для настройки новогоПроект JS: в меню «Файл» выберите -> Новый проект.
Шаг 1: Выберите HTML5 в категориях и приложение HTML5 в проектах 
Шаг2: Назовите вашу заявку.
Шаг 3: Выберите шаблон сайта.
Шаг 4: Поиск доступных библиотек, нажмите на номер версии, чтобы загрузить предыдущие версии.
Закончите, и все готово.
NetBeans 7.3 (запланированный к выпуску в феврале 2013 г.) представляет новый тип проекта, оптимизированный для разработки клиентских веб-приложений.Этот новый тип проекта можно найти в мастере создания нового проекта в категории «HTML / JavaScript».Поддержка проектов HTML включена по умолчанию для комплектов NetBeans PHP и Java, для других его необходимо загрузить в виде плагина.
см. http://wiki.netbeans.org/NetBeans_73_NewAndNoteworthy#Project_Creation
Оригинальный ответ:
File> New Project> PHP > PHP Web Application
.. Звучит как дерьмо, но работает нормально.Потому что в NetBeans еще нет проектов Javascript или HTML (в 7.0.1).