Просто посмотрел на это очень быстро - нашел пару происходящих вещей, которые определенно испортят вас. Прежде всего, просто отладьте эту страницу, и вы получите серьезную ошибку «Builder не определен» - это означает, что что-то не так с тем, как вы связываете Scriptaculous (я не потратил никакого времени ни с одним из них, так что исправление остается за вами, но вот где ваша проблема). Проверьте это, и это должно решить вашу проблему лайтбокса.
Ваша вспышка исчезает, потому что вы устанавливаете ее видимость скрытой - я предполагаю, что вспышка будет всплывать над лайтбоксом, и в то время это казалось хорошей идеей. И если честно, если вы просто используете вспышку для простого переноса, то это не та технология, которая нужна для работы. Простой перенос ролика в javascript будет намного проще в использовании и будет работать точно так же.
Надеюсь, что это поможет вам в правильном направлении.