Вам следует проверять файлы php.ini и .htaccess, а не только панель управления (что бы это ни было).
Чтобы проверить, что находится в php.ini, а что переопределено локально, создайте новый файл php, содержащий:
<?php phpinfo(); ?>
В этом списке будут перечислены все ваши директивы, произведите поиск по запросу «upload» и посмотрите значения. Если в вашем php.ini установлено значение 0, обновите его. В противном случае для локально различных значений найдите в файлах .htaccess сообщение php_value или php_admin_value.
Если в корневом веб-каталоге нет файла .htaccess, попробуйте создать его с php_admin_value file_uploads 1.