Aptana Studio (как и Eclipse) открывает файлы в режиме только для чтения, когда файлы доступны только для чтения в файловой системе. «*» (звездочка) на вкладке редактора означает, что файл был изменен с момента открытия, и при закрытии вам будет предложено либо сохранить, либо закрыть без сохранения.
Ура,
Max