Я подозреваю, что вы действительно хотите сделать это применить «очистку кода» ко ВСЕМ вашим исходным java-файлам, а не только к тем, которые вы выбрали вручную.
Вот как:
1) В представлении «Пакеты» (или представлении «Проводник пакетов») измените «Представление пакета» с «иерархического» на «плоское». В верхнем правом углу каждого вида есть маленький перевернутый треугольник, который позволяет изменить этот параметр.
2) Теперь, когда вы перейдете в каталог с исходным кодом, вы должны увидеть ВСЕ пакеты, подпакеты и подпакеты, содержащие ваши исходные файлы java, все они представлены вместе в одном (возможно, огромном) списке.
3) Конечно, когда у вас есть огромный список, подобный этому, вы можете легко выбрать все пакеты (щелкните левой кнопкой мыши первый пакет, затем нажмите левую кнопку мыши, чтобы щелкнуть последний пакет).
4) Затем щелкните правой кнопкой мыши на выделении и перейдите к «Source-> Clean Up ...» (или любому другому элементу подменю «Source», например «Organize Imports»), и всплывающее диалоговое окно покажет Вы сколько исходных файлов собираетесь изменить.
Надеюсь, это поможет!