Панель по умолчанию содержит VerticalLayout, но вы можете изменить его на любой другой макет, какой пожелаете.
Таким образом, вы не можете говорить о преимуществах как таковых, просто о дополнительных функциях поверх VerticalLayout.
Компонент Panel обеспечивает прокрутку и возможность визуального оформления содержимого, которое он инкапсулирует.Вот и все.