Есть ли у вашего флажка идентификатор? Если нет или если он неизвестен во время разработки, почему бы не предоставить вашему флажку класс CSS - а затем просто использовать селектор, чтобы выбрать класс и отключить флажок?
Например, если вы установите для флажка CSS-класс «MyCheckboxCSSClass» (который на самом деле вообще не нужно нигде определять - укажите имя, если хотите), вы можете затем отключить все флажки с этим классом вот так:
$(".MyCheckboxCSSClass").attr("disabled", true);
Я уверен, что это упростит вам весь процесс.