Рекомендации по многомерной графике для R

Question

Не могли бы вы порекомендовать лучший способ визуализации данных с четырьмя переменными в любом из доступных пакетов R.

А именно, у меня есть две категориальные переменные (совокупности (12) и символы (50)) и две непрерывные переменные (среднее значение и коэффициент вариации каждого измерения длины символа для 100 человек (строки в матрице)).Так что это в основном размерный график 12x50x100x100.

Есть предложения?

Answer 1

Я бы вычерчивал переменные сначала одну за другой, затем вместе, начиная со всей совокупности и постепенно разбивая данные на различные группы.

# Sample data
n1 <- 6   # Was: 12
n2 <- 5   # Was: 50
n3 <- 10  # Was: 100
d1 <- data.frame(
  population = rep(LETTERS[1:n1], each=n2*n3),
  character = rep(1:n2, each=n3, times=12),
  id = 1:(n1*n2*n3),
  mean = rnorm(n1*n2*n3),
  var  = rchisq(n1*n2*n3, df=5)
)
# Not used, but often useful with ggplot2
library(reshape2)
d2 <- melt(d1, id.vars=c("population","character","id"))

# Look at the first variable
library(lattice)
densityplot( ~ mean, data=d1 )
densityplot( ~ mean, groups=population, data=d1 )
densityplot( ~ mean | population, groups=character, data=d1 )

# Look at the second variable
densityplot( ~ var, data=d1 )
densityplot( ~ var, groups=population, data=d1 )
densityplot( ~ var | population, groups=character, data=d1 )

# Look at both variables
xyplot( mean ~ var, data=d1 )
xyplot( mean ~ var, groups=population, data=d1 )
xyplot( mean ~ var | population, groups=character, data=d1 )

# The plots may be more readable with lines rather than points
xyplot( 
  mean ~ var | population, groups = character, 
  data = d1, 
  panel = panel.superpose, panel.groups = panel.loess
)

Answer 2

Рассмотрим lattice, если вы хотите построить серию «кусочков» в одном или другом измерении ваших данных.Почему бы не зайти на http://addictedtor.free.fr/graphiques/ и посмотреть, написал ли кто-нибудь код для создания нужного вам графика?