У меня была похожая проблема .. У меня есть приложение, которое имеет много графических ресурсов, поэтому существуют разные версии для разных рынков.Поэтому у меня есть цель для каждой локализации.
Мне пришлось поместить строковые файлы в разные папки, после чего я мог добавить папки к их целевым объектам.
Может быть, вы также можете разделить свои локализациив две папки и добавьте одну только к цели ipad.