Я просто использовал технику Фрэнсиса и реализовал версию jQuery
$('html,body').animate(
{scrollTop: $(".scroll_to_me").offset().top},
{duration: 1000, step: function(top_offset){
FB.Canvas.scrollTo(0, top_offset + 30);
}
});
Вам необходимо заменить .scroll_to_me
на селектор, к которому вы хотите перейти. Также я добавил + 30
к смещению, так как iframe не начинается в верхней части страницы, вы можете настроить это.