Вам понадобится способ связи с последовательным портом. Веб-браузеры, как правило, не могут этого сделать, поэтому вы, вероятно, захотите вызвать программу в системе.
Один из способов сделать это - использовать Java Server Pages - вы можете вызвать приложение Java, используя JNI для связи с последовательным портом. Ищите в Интернете библиотеки последовательной связи, используя ваш любимый язык.