Вы можете создать представление, которое возвращает дешифрованные данные.
Например:
CREATE VIEW [your_view_name] as
SELECT
CONVERT(varchar(200),DECRYPTBYPASSPHRASE('[your_symmetric_key]', [encrypted_field])) As [encrypted_field],
FROM [your_table_name]
Затем добавьте ваше представление как сущность в вашу модель EF.
Чтобы вставить, обновить или удалить операции, используйте хранимые процедуры.