Я бы просто "выбрал" все источники:
git fetch origin
теперь, когда в вашем репо вы можете объединить ветки в мастер:
git checkout master
git merge origin/feature1
git merge origin/feature2
теперь вы можете объединитьмастер разработки
git checkout develop
git merge master
если вы собираетесь зафиксировать исходную точку, тогда я бы настроил локальную ветвь отслеживания, чтобы вы могли иметь локальный доступ и сразу перейти к исходной точке:
git branch --track origin/feature1 feature1