Сначала проверьте кэш ClickOnce и посмотрите, есть ли там файлы. Похоже, что он устанавливает его нормально. Скорее всего, проблема (в 99% случаев) в том, что ваше приложение аварийно завершает работу, прежде чем оно сможет это показать.
Попробуйте поместить окно сообщения или что-то в самой первой части вашего приложения и разверните и установите его - вы видите окно сообщения? Или добавить некоторые записи. Или что-то .
Вы обрабатываете исключение Unhandled Exception для своего приложения?