(Воскрешение старого вопроса!)
В качестве примера для Lucene.Net 2.9.4g:
var moreLikeThis = new Lucene.Net.Search.Similar.MoreLikeThis(indexReader);
moreLikeThis.SetAnalyzer(analyzer);
moreLikeThis.SetFieldNames(fieldNames);
moreLikeThis.SetStopWords(stopWords);
moreLikeThis.SetMinWordLen(2);
var query = moreLikeThis.Like(new System.IO.StringReader(similarity));
При этом создается объект Lucene.Net.Search.Query, который можно использовать для поиска документов, похожих на текст, передаваемый в объект StringReader.