Более одной проблемы. Вы не сохранили изображение в формате BMP. Формат по умолчанию для Image.Save (строка) - PNG. Кодер PNG, встроенный в GDI +, не поддерживает изображения с разрешением 48 бит / дюйм. Для сохранения в формате BMP необходимо указать формат изображения:
Bitmap img1 = new Bitmap(100, 100, PixelFormat.Format48bppRgb);
img1.Save("c:/temp/img1.bmp", ImageFormat.Bmp);
Однако вы обнаружите, что кодировщик BMP также не поддерживает изображения с разрешением 48 бит / с, вы получите изображение с разрешением 24 бит / с при загрузке. Ни один из кодеков не поддерживает 48bpp.
В GDI + много недостающей функциональности. Например, ImageFormat.Icon не работает, фактически сохраняет PNG. А поддержка любого из форматов индексированных пикселей довольно скудна. Если вам нужна такая поддержка, вам понадобится профессиональная библиотека изображений. LeadTools или ImageMagick являются обычным выбором.