Смысл использования JSF - избегать написания JavaScript, если это не является абсолютно необходимым. JSF позволяет указать файл .css или оформить все приложение, используя уже имеющийся скин, который будет варьироваться в зависимости от вашего выбора реализации JSF. Вам просто нужно добавить один тег в ваш Face-config.xml .
<skin-family>myskin</skin-family>
Если вы можете быть более точным в отношении того, что вы пытаетесь выполнить с помощью JS, я уверен, что BalusC и другие сотрудники предложат вам более простой способ сделать это с помощью самого JSF.