Xcode 4 не создает архитектуру PPC (и не работает ни для одной ОС до 10.6).
Вам необходимо убедиться, что ваша программа и библиотека libsqlite3.dylib созданы для одного и того жеархитектура.Я подозреваю, что библиотека создана для x86.
Как уже говорили другие, используйте команду "file", чтобы определить, для какой архитектуры был создан файл.