Вы можете добавить 32-битный JDK 1.6 в качестве одной из платформ Java, открыв диалоговое окно «Диспетчер платформ Java»
Tools->Java Platforms->Add Platform...
и укажите его на 32-битный путь JDK 1.6.
Тогда вы можете позволить вашему проекту использовать платформу, которую вы добавили
(right-click project)->Properties->Libraries->Java Platform
Существует также кнопка «Управление платформами» в вышеприведенном диалоговом окне в свойствах проекта, которая приведет вас непосредственно к диалоговому окну «Диспетчер платформ Java».