В принципе, вы не можете. Если вам нужно запустить что-то на стороне клиента, вам понадобится совсем другой механизм, предположительно, со встроенной защитой. В предыдущем постере упоминался psexec (http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb897553.aspx),, который, очевидно, будет работать только при наличии соответствующих разрешений на целевая система, которая полностью находится за пределами браузера.
По сути, вы запрашиваете БОЛЬШУЮ, БОЛЬШУЮ проблему, если вам было легко это сделать.
Вы можете посмотреть на ActiveX, но я не знаю, какие ограничения существуют для объекта ActiveX в эти дни (я знаю, что есть ограничения, но, возможно, вы можете работать с ними).