Нет проблем - установщик Xcode 3 позволяет вам выбрать каталог установки - я предпочитаю установить его в /Developer-old
для согласованности с более ранними установщиками Xcode 4, но вы можете поместить его в любое место, возможно, даже создать подпапкув папке установки Xcode 4 для Xcode 3.