Его нельзя закрыть, но вы можете удалить кнопку OK, указав функцию callback
в качестве 3-го параметра:
jAlert('my message', 'message', function() { $('#popup_ok').hide(); });
Но серьезно подумайте об этом, потому что порождаются незапрашиваемые диалоговые окна, выигранныене в восторге от вашего сайта.