Не думаю, что есть что-то конкретно против YAML. Просто JSON достаточно хорош. Это просто, оно развернуто везде, в нем много инструментов, оберните его в обратный вызов, и вы получите междоменные запросы. И это не очень сложно писать вручную. Любой формат, который хочет конкурировать с JSON, должен преодолеть свои сетевые эффекты, что не является тривиальной задачей.
XML в основном просто унаследован, опять же подвержен влиянию сети.