Да, я предпочитаю отдельный набор для каждого раздела сайта.
Поскольку вы используете PHPUnit, если вы хотите запускать тесты параллельно, вы должны создать один класс для одного потока.
Если вы используете раздел сайта, то у вас не будет Зависимостей одного раздела сайта от другого. Так что вы можете запускать тесты параллельно.
Создайте секционную библиотеку и пакет, чтобы вы могли запускать наборы в параллельном режиме.