Я нашел ответ сам, поэтому я решил поделиться им:
IndexSetCollection sets = Examine.LuceneEngine.Config.IndexSets.Instance.Sets;
IndexSet set = sets["Set_Name"];
DirectoryInfo dir = set.IndexDirectory;
string path = Path.Combine(dir.FullName, "Index");
И, очевидно, у меня есть все свойства каталога набора и из объекта DirectoryInfo.
Надеюсьэто кому-то помогает.