Если ваш веб-хост всегда возвращает результат HTTP «200 OK», независимо от того, существует файл или нет (последний должен выдавать «404 Not Found»), браузер не может определить, получил ли он скрипт или нет.
Вы можете попытаться получить файлы через XMLHttpRequest, проверить данные и, если они выглядят как JS, либо eval (), либо создать тег сценария, указывающий на тот же URL-адрес, который вы загрузили (если сценарий кэшируется, больше не будет передаваться, так как в браузере он уже есть).