Я установил частное репо с компьютера с Windows на GitHub.Сейчас я пытаюсь настроить доступ к этому репо с того же имени пользователя на ПК с Linux.Инструкции одинаковые?
Да. Вы можете настроить другой ключ ssh и добавить его в свою учетную запись или скопировать файл id_rsa.
Вот основные инструкции от GitHub http://help.github.com/linux-set-up-git/