EF не имеет встроенной поддержки для этого типа таблиц. В EF один класс = одно отображение = одна таблица (кроме особых случаев, таких как наследование или разбиение). Более того, предполагается, что все эти функции определены во время разработки, а база данных не изменяется во время выполнения.
Простой совет: не используйте EF для этого. Используйте прямой SQL или некоторую абстракцию SQL (представление, хранимые процедуры) между таблицами и EF. В противном случае вам придется манипулировать отображением для каждого запроса, а это непросто - это означает манипулирование файлом EDMX.