Рассмотрим пример, где у вас было 1000 строк, и вы удалили идентификатор строки = 1.Ожидаете ли вы, что следующей записи будет присвоен идентификатор 1001?или 1?
Это работает так, как задумано, хотя если вам это абсолютно необходимо, вы можете вручную установить значение, как и в любом другом столбце в MySQL.