Можно, но не без работы. Вы можете увидеть подробности чужой проблемы и их решение на форуме CodeIgniter .
Обычно вам нужно взять cookie, который CodeIgniter использует для обработки своих сеансов, и десериализовать его:
$sess = unserialize($_COOKIE['ci_session']);
Возможно, вам также потребуется изменить настройки в вашем приложении, чтобы файлы cookie устанавливались для всего домена, а не только для папки, в которой находится CodeIgniter.