На основе ссылок Скотта информацию о текущей версии CF можно найти в реестре устройства по адресу:
HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\.NETCompactFramework
Версии для CF 2.0:
CompactFrameworks 2.0 RTM - 2.0.5238.00
CompactFrameworks 2.0 SP1 - 2.0.6129.00
CompactFrameworks 2.0 SP2 - 2.0.7045.00