Вам понадобятся два отдельных приложения.
Один для чтения данных из последовательного порта и отправки их в ваше веб-приложение через веб-службы для записи в базу данных.
Вторым будет реальное веб-приложение, включая веб-службы для получения и записи данных в базу данных, а также отображения данных на сайте после их загрузки.