Например, в iPhoneFaceSamplesSomething отсутствуют некоторые файлы, которые можно получить из других частей проекта (jpg, xml) или просто игнорировать (png). Вы получаете кучу предупреждений, потому что они добавили библиотеки OS X, которые XCode игнорирует, ничего страшного. А потом для iPhone не хватает некоторых библиотек, таких как opencv highgui и некоторые другие. Вы должны попытаться получить их откуда-то еще или собрать их самостоятельно. Определение проекта немного грязное, вы также можете отправить сообщение об ошибке в github.