Где вам нужно взять идентификатор окна, из внешней программы, отдельной от браузера, или из JavaScript, или как?
У div не будет собственного окна X; скорее всего, единственное окно X предназначено для всей веб-страницы, или в некоторых браузерах, может быть, даже для всего окна браузера, включая панели инструментов.
Возможно, вы можете написать плагин. Плагин (по крайней мере, на данный момент будущие спецификации могут изменить это) может иметь свое собственное окно X. Flash делает, например.